El Euro-Institut Pyrene se apoya así en un enfoque claramente pluridisciplinar, que permite cruzar perspectivas del derecho, pero también de la economía, la geografía, la ciencia política, la sociología o la ordenación del territorio, en función de los retos transfronterizos analizados. Más allá del partenariado universitario, el EIP asocia desde su origen a las autoridades locales fronterizas, con el fin de garantizar un fuerte arraigo territorial y una adecuación real a las necesidades del terreno. En conjunto, estos socios constituyen un consorcio de excelencia, al servicio de una cooperación más integrada, eficaz y duradera entre Nueva Aquitania, Navarra y Euskadi.